Jennifer Lien stand schon im Alter von 13 Jahren in zahlreichen Stücken wie Othello und Der Sturm auf der Bühne. Nur wenige Jahre später wechselte sie vor die Kamera. Ihren Durchbruch schaffte sie 1990 in der Seifenoper Another World, wo sie zwei Jahre lang das Waisenmädchen Hannah Moore spielte.

In der Fernsehserie Star Trek: Raumschiff Voyager spielte sie 1995 bis 1997 die Ocampa Kes. 1998 war sie im Film American History X als Schwester von Derek (Edward Norton), Davina Vinyard zu sehen.